Законопроектом предлагается уточнить перечень объектов, в отношении которых Счетная палата может проводить контрольные и экспертно-аналитические мероприятия. Принятие данной поправки позволит контрольному ведомству проводить проверки правильности и эффективности использования негосударственными пенсионными фондами и страховыми медицинскими организациями передаваемых им государственных средств (страховых взносов на обязательное социальное страхование).

Кроме этого, поправки уточняют экспертные полномочия Счетной палаты. Так, предлагается наделить контрольное ведомство правом проводить экспертизу и готовить заключения на законопроекты, принятие которых может привести к изменению доходов федерального бюджета и бюджетов государственных внебюджетных фондов.

Ко второму чтению законопроект был дополнен поправками, усиливающими полномочия Счетной палаты в части контроля за исполнением представлений. Согласно вносимым изменениям, представление теперь может быть направлено не только по результатам контрольного мероприятия, но и непосредственно в ходе его проведения в случае выявления нарушений в хозяйственной, финансовой, коммерческой и иной деятельности объектов аудита, наносящих ущерб государству и требующих в связи с этим безотлагательного пресечения, а также при создании препятствий для проведения контрольных и экспертно-аналитических мероприятий.

Кроме того, срок рассмотрения представления может быть продлен решением Коллегии Счетной палаты не более одного раза, после чего в случаях невыполнения представлений и несоблюдения сроков их рассмотрения Счетная палата направляет руководителям объектов аудита обязательные для исполнения предписания. Если раньше допускалось неоднократное неисполнение предписаний, то теперь приостановление всех видов финансовых платежей и расчетных операций по счетам объектов контроля может применяться уже при однократном неисполнении предписания или его ненадлежащем исполнении.