Счетная палата также получила право проводить экспертизу и готовить заключения на законопроекты, принятие которых может привести к изменению доходов федерального бюджета и бюджетов государственных внебюджетных фондов. Полномочия контрольного ведомства скорректированы и в соответствии с недавно принятым федеральным законом о стратегическом планировании.

Усилены полномочия Счетной палаты в части контроля за исполнением представлений. Так, представление теперь может быть направлено не только по результатам контрольного мероприятия, но и непосредственно в ходе его проведения в случае выявления нарушений в хозяйственной, финансовой, коммерческой и иной деятельности объектов аудита, наносящих ущерб государству и требующих в связи с этим безотлагательного пресечения, а также при создании препятствий для проведения контрольных и экспертно-аналитических мероприятий. Кроме того, срок рассмотрения представления может быть продлен решением Коллегии Счетной палаты не более одного раза, после чего в случаях невыполнения представлений и несоблюдения сроков их рассмотрения Счетная палата направляет руководителям объектов аудита (контроля) обязательные для исполнения предписания. При этом если раньше допускалось неоднократное неисполнение предписаний, после чего Счетная палата могла по согласованию с Государственной Думой принять решение о приостановлении всех видов финансовых платежей и расчетных операций по счетам объектов контроля. То теперь эта мера может применяться уже при однократном неисполнении предписания или его ненадлежащем исполнении.